O Hospital Evangélico oferece um setor de endoscopia e broncoscopia, desde 2012, com serviços de endoscopia digestiva alta, colonoscopia, retossigmoidoscopia rígida e flexível e broncoscopia. Atende pacientes do Sistema Único de Saúde (SUS), através do Sistema SisREG, convênios, particulares, conforme demanda, e também paciente internados no Hospital e veio para acelerar o diagnóstico de algumas patologias, além de auxiliar nas situações de emergências com sangramentos gastrointestinais e pulmonares.